Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA13Q9P0J0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA13Q9P0J0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms