Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms