Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL28Q9NXS3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL28Q9NXS3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms