Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms