Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TOR4AQ9NXH8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms