Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms