Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMSN1Q9NSI8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms