Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms