Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms