Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms