Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms