Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms