Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms