Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms