Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A2Q9HAB3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms