Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms