Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms