Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED28Q9H204 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms