Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms