Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT23Q9C075 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms