Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
YTHDF1Q9BYJ9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms