Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms