Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRTQ9BXP5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms