Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms