Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms