Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms