Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms