Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms