Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRNP1Q96S65 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms