Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms