Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms