Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms