Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP4CQ96CF2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms