Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1AQ96AJ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms