Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UTP4Q969X6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UTP4Q969X6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms