Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms