Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNERQ8NFT8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNERQ8NFT8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms