Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms