Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6K7

SAMD3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD3Q8N6K7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD3Q8N6K7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD3Q8N6K7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms