Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CLDN19Q8N6F1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CLDN19Q8N6F1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CLDN19Q8N6F1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CLDN19Q8N6F1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN19Q8N6F1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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CLDN19Q8N6F1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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CLDN19Q8N6F1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN19Q8N6F1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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