Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CLIP4Q8N3C7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CLIP4Q8N3C7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CLIP4Q8N3C7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CLIP4Q8N3C7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CLIP4Q8N3C7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CLIP4Q8N3C7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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