Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIX1LQ8IVB5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms