Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAPLN4Q86UW8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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