Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms