Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SV2AQ7L0J3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms