Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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