Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms