Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms