Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A1Q6PCB7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A1Q6PCB7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms