Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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